El paquete ciecl trabaja principalmente en español de
Chile, pero ofrece búsqueda multilingüe cuando la fuente de datos lo
permite. La tabla resume el comportamiento por función.
| Función | Idioma dataset | Idioma búsqueda | Notas |
|---|---|---|---|
cie_lookup() |
Español (Chile) | — | Búsqueda por código; idioma no aplica |
cie_search() |
Español (Chile) | Español | Descripciones en español chileno |
cie11_search() |
Español / Inglés | Español / Inglés | Configurable vía parámetro lang |
cie10_sql() |
Español (Chile) | SQL | Columna descripcion en español |
El dataset cie10_cl contiene los códigos vigentes con
descripciones en español chileno según el catálogo oficial MINSAL/DEIS
v2018. Ver ?cie10_cl para el detalle de columnas.
library(ciecl)
head(cie10_cl[, c("codigo", "descripcion", "capitulo")])
#> # A tibble: 6 × 3
#> codigo descripcion capitulo
#> <chr> <chr> <chr>
#> 1 A00 Cólera A00
#> 2 A00.0 Cólera debido a Vibrio cholerae O1, biotipo cholerae A00
#> 3 A00.1 Cólera debido a Vibrio cholerae O1, biotipo El Tor A00
#> 4 A00.9 Cólera, no especificado A00
#> 5 A01 Fiebres tifoidea y paratifoidea A01
#> 6 A01.0 Fiebre tifoidea A01La columna descripcion conserva tildes y eñes del
catálogo original. Esto es importante porque muchas rutinas de limpieza
despojan los acentos; en ciecl la normalización ocurre solo
en la etapa de búsqueda, no en el dato almacenado.
cie_search() normaliza internamente la consulta para que
el usuario pueda escribir con o sin tildes. Esto es especialmente útil
en datos clínicos mezclados, donde el mismo término aparece con y sin
acento.
# Con o sin tilde: mismo resultado
cie_search("neumonia")
#> # A tibble: 50 × 4
#> codigo descripcion score categoria
#> <chr> <chr> <dbl> <chr>
#> 1 B01.2 Neumonía debida a varicela (J17.1*) 1 B01 VARI…
#> 2 B05.2 Sarampión complicado con neumonía (J17.1*) 1 B05 SARA…
#> 3 B20.6 Enfermedad por VIH, resultante en neumonía por Pneumo… 1 B20 ENFE…
#> 4 J10.0 Influenza con neumonía, debida a otro virus de la inf… 1 J10 INFL…
#> 5 J11.0 Influenza con neumonía, virus no identificado 1 J11 INFL…
#> 6 J12 Neumonía viral, no clasificada en otra parte 1 J12 NEUM…
#> 7 J12.0 Neumonía debida a adenovirus 1 J12 NEUM…
#> 8 J12.1 Neumonía debida a virus sincitial respiratorio 1 J12 NEUM…
#> 9 J12.2 Neumonía debida a virus parainfluenza 1 J12 NEUM…
#> 10 J12.3 Neumonía por metapneumovirus humano 1 J12 NEUM…
#> # ℹ 40 more rows
cie_search("neumonía")
#> # A tibble: 50 × 4
#> codigo descripcion score categoria
#> <chr> <chr> <dbl> <chr>
#> 1 B01.2 Neumonía debida a varicela (J17.1*) 1 B01 VARI…
#> 2 B05.2 Sarampión complicado con neumonía (J17.1*) 1 B05 SARA…
#> 3 B20.6 Enfermedad por VIH, resultante en neumonía por Pneumo… 1 B20 ENFE…
#> 4 J10.0 Influenza con neumonía, debida a otro virus de la inf… 1 J10 INFL…
#> 5 J11.0 Influenza con neumonía, virus no identificado 1 J11 INFL…
#> 6 J12 Neumonía viral, no clasificada en otra parte 1 J12 NEUM…
#> 7 J12.0 Neumonía debida a adenovirus 1 J12 NEUM…
#> 8 J12.1 Neumonía debida a virus sincitial respiratorio 1 J12 NEUM…
#> 9 J12.2 Neumonía debida a virus parainfluenza 1 J12 NEUM…
#> 10 J12.3 Neumonía por metapneumovirus humano 1 J12 NEUM…
#> # ℹ 40 more rows
cie_search("NEUMONIA")
#> # A tibble: 50 × 4
#> codigo descripcion score categoria
#> <chr> <chr> <dbl> <chr>
#> 1 B01.2 Neumonía debida a varicela (J17.1*) 1 B01 VARI…
#> 2 B05.2 Sarampión complicado con neumonía (J17.1*) 1 B05 SARA…
#> 3 B20.6 Enfermedad por VIH, resultante en neumonía por Pneumo… 1 B20 ENFE…
#> 4 J10.0 Influenza con neumonía, debida a otro virus de la inf… 1 J10 INFL…
#> 5 J11.0 Influenza con neumonía, virus no identificado 1 J11 INFL…
#> 6 J12 Neumonía viral, no clasificada en otra parte 1 J12 NEUM…
#> 7 J12.0 Neumonía debida a adenovirus 1 J12 NEUM…
#> 8 J12.1 Neumonía debida a virus sincitial respiratorio 1 J12 NEUM…
#> 9 J12.2 Neumonía debida a virus parainfluenza 1 J12 NEUM…
#> 10 J12.3 Neumonía por metapneumovirus humano 1 J12 NEUM…
#> # ℹ 40 more rowsLa misma lógica aplica a la eñe: buscar "rinon"
encuentra “Riñón” en el catálogo.
cie_search("rinon")
#> # A tibble: 49 × 4
#> codigo descripcion score categoria
#> <chr> <chr> <dbl> <chr>
#> 1 C64 Tumor maligno del riñón, excepto de la pelvis renal 1 C64 TUMO…
#> 2 C79.0 Tumor maligno secundario del riñón y de la pelvis re… 1 C79 TUMO…
#> 3 D30.0 Tumor benigno del riñón 1 D30 TUMO…
#> 4 D41.0 Tumor de comportamiento incierto o desconocido del r… 1 D41 TUMO…
#> 5 M8964/3 Sarcoma de células claras del riñón (C64) 1 M893-M89…
#> 6 M8964/6 Sarcoma de células claras del riñón (C64), metastási… 1 M893-M89…
#> 7 M9044/3 Sarcoma de células claras (excepto del riñón M8964/3) 1 M904-M90…
#> 8 M9044/6 Sarcoma de células claras (excepto del riñón M8964/3… 1 M904-M90…
#> 9 N13.2 Hidronefrosis con obstrucción por cálculos del riñón… 1 N13 UROP…
#> 10 N20 Cálculo del riñón y del uréter 1 N20 CÁLC…
#> # ℹ 39 more rowsEl paquete incluye un diccionario de siglas médicas
de uso clínico en Chile. Esto permite que un analista escriba
IAM en vez del código completo y ciecl
resuelva la sigla al término oficial del catálogo.
# Listar todas las siglas disponibles
head(cie_short())
#> # A tibble: 6 × 3
#> sigla termino_busqueda categoria
#> <chr> <chr> <chr>
#> 1 iam infarto agudo miocardio cardiovascular
#> 2 iamcest infarto agudo miocardio cardiovascular
#> 3 iamsest infarto agudo miocardio cardiovascular
#> 4 sca sindrome coronario agudo cardiovascular
#> 5 hta hipertension arterial cardiovascular
#> 6 aha hipertension arterial cardiovascular
# Filtrar por categoría
cie_short(category = "cardiovascular")
#> # A tibble: 15 × 3
#> sigla termino_busqueda categoria
#> <chr> <chr> <chr>
#> 1 iam infarto agudo miocardio cardiovascular
#> 2 iamcest infarto agudo miocardio cardiovascular
#> 3 iamsest infarto agudo miocardio cardiovascular
#> 4 sca sindrome coronario agudo cardiovascular
#> 5 hta hipertension arterial cardiovascular
#> 6 aha hipertension arterial cardiovascular
#> 7 icc insuficiencia cardiaca cardiovascular
#> 8 ic insuficiencia cardiaca cardiovascular
#> 9 fa fibrilacion auricular cardiovascular
#> 10 tep embolia pulmonar cardiovascular
#> 11 tvp trombosis venosa profunda cardiovascular
#> 12 eap edema agudo pulmon cardiovascular
#> 13 acv accidente cerebrovascular cardiovascular
#> 14 ave accidente vascular encefalico cardiovascular
#> 15 ait isquemico transitorio cardiovascular
# Usar la sigla directamente en búsqueda
cie_search("IAM") # Infarto Agudo del Miocardio
#> ℹ Sigla detectada: "IAM" -> "infarto agudo miocardio"
#> # A tibble: 50 × 4
#> codigo descripcion score categoria
#> <chr> <chr> <dbl> <chr>
#> 1 I21 Infarto agudo del miocardio 1 I21 INFA…
#> 2 I21.0 Infarto transmural agudo del miocardio de la pared an… 1 I21 INFA…
#> 3 I21.1 Infarto transmural agudo del miocardio de la pared in… 1 I21 INFA…
#> 4 I21.2 Infarto agudo transmural del miocardio de otros sitios 1 I21 INFA…
#> 5 I21.3 Infarto transmural agudo del miocardio, de sitio no e… 1 I21 INFA…
#> 6 I21.4 Infarto subendocárdico agudo del miocardio 1 I21 INFA…
#> 7 I21.9 Infarto agudo del miocardio, sin otra especificación 1 I21 INFA…
#> 8 I23 Ciertas complicaciones presentes posteriores al infar… 1 I23 CIER…
#> 9 I23.0 Hemopericardio como complicación presente posterior a… 1 I23 CIER…
#> 10 I23.3 Ruptura de la pared cardíaca sin hemopericardio como … 1 I23 CIER…
#> # ℹ 40 more rows
cie_search("EPOC") # Enfermedad Pulmonar Obstructiva Crónica
#> ℹ Sigla detectada: "EPOC" -> "enfermedad pulmonar obstructiva cronica"
#> # A tibble: 3 × 4
#> codigo descripcion score categoria
#> <chr> <chr> <dbl> <chr>
#> 1 J44.0 Enfermedad pulmonar obstructiva crónica con infección … 1 J44 OTRA…
#> 2 J44.1 Enfermedad pulmonar obstructiva crónica con exacerbaci… 1 J44 OTRA…
#> 3 J44.9 Enfermedad pulmonar obstructiva crónica, no especifica… 1 J44 OTRA…
cie_search("DM2") # Diabetes Mellitus tipo 2
#> ℹ Sigla detectada: "DM2" -> "diabetes mellitus tipo 2"
#> # A tibble: 11 × 4
#> codigo descripcion score categoria
#> <chr> <chr> <dbl> <chr>
#> 1 E11.0 Diabetes mellitus tipo 2 con coma 1 E11 DIAB…
#> 2 E11.1 Diabetes mellitus tipo 2 con cetoacidosis 1 E11 DIAB…
#> 3 E11.2 Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones renales 1 E11 DIAB…
#> 4 E11.3 Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones oftálmicas 1 E11 DIAB…
#> 5 E11.4 Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones neurológi… 1 E11 DIAB…
#> 6 E11.5 Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones circulat… 1 E11 DIAB…
#> 7 E11.6 Diabetes mellitus tipo 2 con otras complicaciones es… 1 E11 DIAB…
#> 8 E11.7 Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones múltiples 1 E11 DIAB…
#> 9 E11.8 Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones no especi… 1 E11 DIAB…
#> 10 E11.9 Diabetes mellitus tipo 2 sin complicaciones 1 E11 DIAB…
#> 11 O24.1 Diabetes mellitus tipo 2 preexistente 1 O24 DIAB…La tabla siguiente resume las categorías disponibles y su tamaño aproximado. Los números pueden variar entre versiones del paquete.
| Categoría | Ejemplos |
|---|---|
| Cardiovascular | IAM, HTA, ACV, FA, ICC |
| Respiratoria | TBC, EPOC, NAC, SDRA |
| Metabólica | DM, DM1, DM2, ERC, IRC |
| Gastrointestinal | HDA, HDB, RGE, DHC |
| Infecciosa | VIH, ITU, ITS, sepsis |
| Oncológica | CA, LMA, LMC, LLA, LLC |
| Neurológica | TEC, EPI, EM, ELA |
| Psiquiátrica | TDAH, TOC, TAG, TEPT |
cie11_search() consulta la API oficial de la OMS y
permite especificar el idioma, ya que el servidor de la OMS ofrece
traducciones oficiales. En ciecl se expone el parámetro
lang = "es" (por defecto) o lang = "en".
# Búsqueda en español (por defecto)
# Requiere API Key OMS
cie11_search("diabetes mellitus", lang = "es")Nota: esta sección requiere credenciales de la API OMS. Consulta la vignette Guía de Instalación y Configuración para aprender a guardarlas de forma segura utilizando
keyring.
El paquete está codificado en UTF-8 y el dataset
preserva todos los caracteres del español (tildes, eñe, diéresis) y los
símbolos de codificación dual (daga †, asterisco *) que aparecen en el
catálogo MINSAL. Al buscar, cie_search() y
cie_norm() saben limpiarlos.